O projeto BIOPOLIS visa a transformação do CIBIO num Centro de Excelência (CoE) em I&D&I, através de uma parceria com a Universidade de Montpellier (França) e com a Porto Business School (PBS; Portugal). O projeto prevê estabelecer o BIOPOLIS como um dos melhores Centro de Excelência internacionais em Biologia Ambiental, Investigação de Ecossistemas e AgroBiodiversidade, com a capacidade de difundir a excelência para a inovação nas áreas do Ambiente, Biodiversidade e Agricultura, contribuindo assim para o desenvolvimento socioeconómico. O Centro de Excelência fará progredir os conhecimentos biológicos, dos genes aos ecossistemas, e utilizará esses conhecimentos para enfrentar desafios societais prementes através do desenvolvimento de investigação de nível mundial, do estabelecimento de parcerias estratégicas a longo prazo, da participação das partes interessadas e da transferência e exploração dos resultados da investigação. Este objetivo será atingido atraindo investigadores de topo, proporcionando excelentes condições para a investigação, formação, internacionalização e ligação em rede, alinhando a investigação com os desafios societais e as estratégias de especialização inteligente, participando em programas de formação avançada, desenvolvendo actividades de comunicação, difusão e exploração e estabelecendo um forte programa de afiliados para promover a tradução da investigação e inovação em aplicações e oportunidades comerciais.